این پژوهش با هدف ارائه الگویی جامع برای گزینش و سازماندهی پروژه‌ها در مدیریت سبد پروژه‌های پژوهشی انجام شده است. در این راستا، ابتدا معیارهای انتخاب پروژه با بهره‌گیری از روش دلفی و نظر خبرگان شناسایی شد. سپس برای وزن‌دهی معیارها از روش بهترین–بدترین فازی (Fuzzy BWM) و برای ارزیابی و رتبه‌بندی پروژه‌ها از روش واسپاس فازی (Fuzzy WASPAS) استفاده گردید. مطالعه موردی در یک مؤسسه علمی با بیش از ۵۰۰ پروژه تحقیقاتی سالانه انجام شد که تنها بخشی از آن‌ها به دلیل محدودیت منابع قابل اجرا هستند. نتایج نشان داد که الگوی پیشنهادی قادر است با ترکیب داده‌های کیفی و کمی و با لحاظ معیارهای علمی، فنی و راهبردی، پروژه‌های با ارزش بالاتر را شناسایی و اولویت‌بندی کند. این مدل می‌تواند به مدیران در انتخاب ترکیب بهینه‌ای از پروژه‌ها کمک کرده و از هدررفت منابع جلوگیری نماید. آزمون حساسیت نیز پایداری نتایج روش را در شرایط مختلف تأیید کرد.